Östergötlands länsmuseum genomförde i juli 2007 en efterundersökning i form av en antikvarisk kontroll med anledning av nedläggande av en VA-tank i kvarteret Hospitalsstugorna 2 i Söderköping. Ingreppen hade utförts utan stöd av KML och hade orsakat skador på murar och kulturlager från franciskanerklostret i Söderköping.

Sedan VA-tanken tillfälligt lyfts bort och schaktet rensats upp kunde det konstateras att tanken hade ställts på ett medeltida tegelgolv. Golvet låg i en halvkällarvåning i den sydligaste delen av ett ca 9 x 13 m stort hus. Byggnaden tolkades som medeltida och tillhörande det tidigare klostret. Den norra delen av detta medeltida hus visade sig ligga under, samt utgöra fundament för, ett befintligt bostadshus på tomten. Flera olika byggnadsfaser kunde konstateras i huset eftersom det på tegelgolvet i halvkällaren låg medeltida raseringslager. På dessa lager hade det i sin tur uppförts en strävpelare av tegel i syfte att motverka sättningar i murverket eftersom huset var uppfört i sluttningen ned mot Storån.

I en högre liggande del av huset påträffades en eldstad, något som gör det troligt att detta varit en bostadsdel. Eldstaden hade en omfattning av tegel och hade uppförts i hörnet mellan husets västra yttermur och en tunnare mellanvägg. Huset kan under medeltiden ha utgjort en representationsbyggnad eller ett friliggande hus för klostrets föreståndare. Vid undersökningen påträffades även fynd av keramik, djurben, en medeltida nyckel, en spelbricka av ben samt ett mynt från 1700-talet.