Juni 2021 genomförde Östergötlands museum en arkeologisk undersökning i form av schaktningsövervakning på Ekebyborna kyrkogård i Ekebyborna, Motala kommun. Undersökningen föranleddes av att Borensberg pastorat planerade att schakta för dränering runt kyrkan för att åtgärda fuktproblem.

Vid undersökningen framkom tre intakta gravar invid kyrkans norra vägg. En av gravarna undersöktes, togs tillvara och analyserades. Den visades innehålla en ung individ – sannolikt en kvinna – som utifrån resultatet från kol-14-analysen har levt under slutet av 1200-talet eller början av 1300- talet. Graven var placerad utmed sakristians norra vägg, en tillbyggnad på kyrkan som gjordes under början av 1300-talet.

Övriga gravar gick att undvika genom en justering av schaktdjupet. Gravarna har dokumenterats i plan före schaktet återfylldes. Avståndet mellan en av gravarna och kyrkoväggen antyder att graven är grävd före, och därmed är äldre än, sakristian.

Därutöver påträffades kalkstensmurar väster om tornet som kan vara en äldre västlig begränsningsmur för kyrkogården. På andra sidan kyrkan, öster om koret, framkom rester efter en tidigare sträckning av den östra kyrkogårdsmuren, som härvid har raserats och utvidgats likt en halvcirkel. Det skedde sannolikt kring år 1500 i samband med att koret förlängdes åt öst och fick sin nuvarande form.